Selitetty: Miten koronavirustesti (COVID-19) toimii

Miten PCR-testi etsii virusta vanupuikkonäytteistä? Kauanko se kestää? Kuinka monta näytettä Intia testaa päivittäin, ja voiko se testata enemmän? Jos voi, miksi sitä ei ole vielä laajennettu?

Intia suorittaa tällä hetkellä kaksivaiheista reaaliaikaista PCR:ää SARS-COV-2:n testaamiseksi. (Reuters)

Mikä on diagnostinen testi uudelle koronavirukselle, joka aiheuttaa COVID-19:n?

The Intian lääketieteellisen tutkimuksen neuvosto (ICMR) on sanonut nimettyjen laboratorioiden käyttää tavanomaista reaaliaikaista polymeraasiketjureaktiotestiä (PCR), joka suoritetaan kurkun takaosasta otetulle vanupuikolle, alemmista hengitysteistä otetulle nestenäytteelle tai yksinkertaiselle sylkinäytteelle. Tällaisia ​​testejä käytetään yleisesti influenssa A-, influenssa B- ja H1N1-viruksen havaitsemisessa.

Mikä on PCR-testi?

Se käyttää tekniikkaa, joka luo kopioita DNA-segmentistä. 'Polymeraasi' viittaa entsyymeihin, jotka tekevät kopioita DNA:sta. 'Ketjureaktio' tarkoittaa, kuinka DNA-fragmentit kopioidaan eksponentiaalisesti - yksi kopioidaan kahdeksi, kaksi kopioidaan neljäksi ja niin edelleen. PCR-tekniikan keksijä amerikkalainen biokemisti Kary Mullis sai kemian Nobelin vuonna 1993.

SARS-COV-2 on kuitenkin RNA:sta valmistettu virus, joka on muutettava DNA:ksi. Tätä varten tekniikka sisältää prosessin, jota kutsutaan käänteistranskriptioksi. 'Käänteiskopioijaentsyymi' muuttaa RNA:n DNA:ksi. Sitten DNA:sta tehdään kopioita ja niitä monistetaan. Fluoresoiva DNA:ta sitova väriaine, jota kutsutaan koettimeksi, osoittaa viruksen läsnäolon. Testi erottaa myös SARS-COV-2:n muista viruksista.

Kuinka kauan PCR-prosessi kestää?

Reaaliaikaiset PCR:t ovat vähentäneet näytteiden testaamiseen kuluvaa aikaa 4,5 tuntiin noin 6 tuntia aikaisemmin, ICMR:n tutkija tohtori RR Gangakhedkar sanoi. Kuitenkin yleinen läpimenoaika - näytteiden keräämisestä raportin toimittamiseen - on noin 24 tuntia, ja sen pitäisi olla lyhyempi, hän sanoi.

Selitetty: Viisi askelta koronaviruksen havaitsemiseen

Miten testi tehdään Intiassa?

Intia suorittaa tällä hetkellä kaksivaiheista reaaliaikaista PCR:ää SARS-COV-2:n testaamiseksi, sanoi NIMHANSin vanhempi professori ja neurovirologian johtaja tohtori V Ravi. Ensimmäinen vaihe on suunniteltu tunnistamaan näytteessä mahdollisesti esiintyviä ihmisen koronaviruksille yhteisiä geneettisiä elementtejä. Toinen vaihe on suunniteltu vain SARS-COV-2-viruksen sisältämien tiettyjen geenien testaamiseen.

Maaliskuun alkuun asti alkuseulonta Kaikki laboratoriot tekivät testin minkä tahansa tyyppisen koronaviruksen tarkistamiseksi, mutta vahvistavan PCR:n teki vain Punen kansallinen virologian instituutti. Sitten NIV Pune siirsi tekniikan (vahvistukseen tarvittavat reagenssit) kaikkiin laboratorioihin, jotta näytettä ei tarvitsisi viedä aina Puneen asti. Tämä on vähentänyt näytteiden testaamiseen kuluvaa aikaa, tohtori Ravi sanoi.

Koronavirustestaus: Väärennettyä verta näkyy koronaviruksella (COVID-19) merkityissä koeputkissa tässä 17. maaliskuuta 2020 otetussa kuvassa. (Reutersin kuva: Dado RuvicO

Testaako Intia tarpeeksi lukuja?

Intia pystyy testaamaan 10 000 näytettä päivittäin, ja tällä hetkellä testataan noin 600-700. Vertailun vuoksi Etelä-Korean, jolla on samanlainen läpimenoaika, kerrotaan testaavan jopa 20 000 näytettä päivässä, erityisesti käyttämällä malleja, kuten sen läpiajotestauslaitoksia.

Hallitus väittää, että tässä vaiheessa ei ole tarpeen testata jokaista ihmistä. Maa testaa kohorttia, jota sen on testattava nyt, tohtori Gangakhedkar sanoi. Jos käytät paikallista lähetystä, testaamme tarpeeksi. Jos uskot, että on olemassa yhteisöpohjaista siirtoa, se on eri asia. Ei ole edelleenkään todisteita siitä, että emme tiedä, kuinka indeksitapaus on saanut tämän tartunnan, hän sanoi.

Express Explained on nyt Telegramissa. Klikkaus tästä voit liittyä kanavallemme (@ieexplained) ja pysy ajan tasalla uusimmista

Emme halua tehdä umpimähkäisiä testejä, koska nyt kaikki pyytävät testiä. Joten jossain meidän on järkeistettävä se… mutta on myös tärkeää pitää silmällä, jotta emme jää paitsi yhteisön leviämisestä, ICMR:n tutkija tohtori Nivedita Gupta sanoi lehdistötilaisuudessa viime viikolla.

Mikä on strategia, jos yhteisö leviää?

ICMR valvoo kaikkia todisteita yhteisön leviämisestä, ja jokainen Intian 52 testauslaboratoriosta testaa 20 satunnaisnäytettä potilaista, joilla on vakava akuutti hengitystieinfektio (SARI). Näiden testien 'ensimmäinen leikkaus' odotetaan julkaistavan keskiviikkona. ICMR on sanonut, että jos näistä valvontatesteistä paljastuu yhteisön tartuntatapaus, hallituksen strategiat ovat täysin erilaisia.

Koronaviruspandemia: Sairaalassa New Delhissä. (PTI-kuva/tiedosto)

Onko testauksen laajentamiselle esteitä?

Joidenkin asiantuntijoiden mielestä hinta on mahdollinen este. ICMR:n virkamiehet olivat sanoneet konferenssissa, että COVID-19:n ensisijaisen testin hinta on 1 500 rupiaa. Jos ensimmäisen testin tulosten vahvistamiseksi tehdään toinen testi, kokonaiskustannukset ovat noin 5 000 ruplaa. Eräs virkamiehistä oli myös sanonut, että käytetyt, Saksasta tuodut anturit ovat rajoittava tekijä.

Testauskeskusten määrää on lisätty, mutta myös luotainten tuonti on lisääntynyt. Viime viikolla Intia halusi tuoda noin 200 000 luotainta, kun taas maanantaina tohtori Gangakhedkar sanoi, että hallitus aikoi tuoda noin miljoona.

Koronaviruspandemia: Milloin testata ja kenelle

Voisiko Intia tehdä asiat toisin?

Intian Translational Health Science and Technology Instituten toiminnanjohtajan tohtori Gagandeep Kangin mukaan Intia oli alkanut tehdä juuri sitä, mitä suositeltiin maalle, johon tauti tuotiin. Maahan saapuvien testaus ja seuranta sekä heidän kanssaan kosketuksiin joutuneiden valvonta on kuitenkin järkevä ja asianmukainen lähestymistapa, jos ainoa riski oli taudin maahantuonti ja seuranta ja testaus oli 100 %, hän sanoi.

Mutta mitä voi tapahtua, on se, että tämän infektion seurauksena voit levitä jo ennen kuin sinulla on oireita, ja hyvin harvoilla sinulla ei ehkä koskaan ole oireita, joten voit välittää sen muille ihmisille tietämättäsi, että olet tartunnan saanut, hän sanoi. Tällainen monimutkaisuus… tekee välttämättömäksi harkita varastrategiaa, jotta näet, oletko todella missannut jotain, hän sanoi. Voisimme tehdä muutakin.

Auttaako ICMR-valvonta?

ICMR:n päätös on hyvä askel, mutta on alueita, jotka tällainen harjoitus sitten jättäisi ulkopuolelle, tohtori Kang sanoi. Jos testaat näytteitä joka viikko jokaisesta influenssalaboratoriosta, niin jos löydät edes yhden positiivisen tuloksen, se kertoo, että olet jäänyt paitsi paljon, hän sanoi.

Tohtori Kangin mukaan on mahdollista käyttää matemaattista mallintamista sen ymmärtämiseen, mikä antaisi hallitukselle kohtuullisen mahdollisuuden tunnistaa, onko olemassa jo yhteisön leviämistä. Mielestäni olisi hienoa saada sellainen malli kuin Singaporessa, jossa jokainen lääkäri, jolla oli kliininen epäilys, vaikka se ei vastaisi kuvausta, sai lähettää potilaansa kokeeseen, hän lisäsi.

– Kaunain sheriffi M

Jaa Ystäviesi Kanssa: