Selitetty: Viisi askelta koronaviruksen (COVID-19) havaitsemiseen

Prosessin selitti The Indian Expressille tohtori V Ravi, vanhempi professori ja johtaja, neurovirologian osaston NIMHANS.

Tässä 17. maaliskuuta 2020 otetussa kuvassa näkyy väärennettyä verta koronaviruksella (COVID-19) merkityissä koeputkissa. (Reuters)

Dr V Ravi, vanhempi professori ja johtaja, neurovirologian osaston NIMHANS, selittää koronaviruksen havaitsemisprosessia tämä sivusto . Tässä on viisi vaihetta:

Keräys ja kuljetus

Testauskeskus ottaa vanupuikkoja nenäonteloista ja kurkun takaosasta (nielusta) ja laittaa näytteet viruksenkuljetusalustaan, joka sisältää tasapainotettuja suoloja ja albumiinia estämään viruksen hajoamisen. Näyte kuljetetaan sitten kylmävarastoon testauslaboratorioon.

Viruksen RNA:n uuttaminen

Koronavirukset, kuten SARS-CoV (joka syntyi Kiinassa vuosina 2002-2003), MERS-CoV (joka ilmestyi Saudi-Arabiaan vuonna 2012) tai nykyinen SARS-CoV-2, joka on aiheuttanut COVID-19-pandemian, on suuri. , yksijuosteiset RNA-genomit. Testauslaboratorio erottaa RNA:n näytteistä käyttämällä kaupallisesti saatavia sarjoja (kuten QIAGENin kaltaisten yritysten valmistamia).

RNA:n laittaminen PCR-seokseen

Uutettu RNA lisätään polymeraasiketjureaktion (PCR) seokseen. Tämä sisältää 'masterisekoituksen', joka sisältää 'käänteiskopioijaentsyymin', joka muuttaa RNA:n DNA:ksi. Master mix sisältää Taq-polymeraasia, entsyymiä, joka luo kopioita DNA:sta, nukleotideja sekä muita alkuaineita, kuten magnesiumia – jonka ioni tarvitaan DNA:n monistamiseen.

PCR-seos sisältää myös 'reagensseja', kuten 'alukkeita' ja 'koettimia'. Alukkeet ovat tiettyjä DNA-juosteita, jotka on suunniteltu sitoutumaan kopioitavaan DNA:han; koettimia käytetään spesifisen sekvenssin havaitsemiseen DNA-näytteestä. WHO on suositellut erityisiä alukkeita ja koettimia COVID-19-testaukseen.

Lopuksi PCR-seos koostuu taloudenhoitogeenistä – normaalista ihmisen geenistä (RNaasi P), jota käytetään varmistamaan, että näytteet kerättiin oikein ja RNA uutettiin.

Viruksen DNA:n monistus

PCR-seoksessa oleva näyte laitetaan putkiin tai levyihin, jotka sitten laitetaan lämpökiertokoneeseen, jota käytetään PCR-prosessin suorittamiseen.

Ensin RNA muunnetaan DNA:ksi. Sitten alkaa geenien kopiointiprosessi. Lämpösyklilaite lämmittää ja jäähdyttää seosta näytteen kanssa vuorotellen kolmen lämpötilan välillä – DNA:n sulattamiseksi kahden juosteen erottamiseksi, alukkeen sitoutumiseksi DNA:han ja uuden juosteen syntetisoimiseksi – kaikki yhdessä syklissä, joka kestää minuutti. Lämpösyklilaite suorittaa 30–40 tällaista sykliä monistaakseen DNA:n viruksen tarkistamiseksi.

Testaus kontrollia vastaan

Monistettu DNA testataan positiivista kontrollia vastaan, joka koostuu yleensä plasmidiin kloonatuista viruksen geeneistä, ja negatiivista kontrollia, joka on 'tunnettu' näyte, joka on aiemmin testannut viruksen suhteen negatiivisen.

RNaasi P:n pitäisi näyttää vahvistumista, positiivisen kontrollin tulee olla positiivinen, negatiivisen kontrollin tulee olla negatiivinen, ja sitten mikä tahansa tulos saat näytteestä, on oikea tulos, sanoi neurovirologi tohtori V Ravi. Jotta testi olisi pätevä ennen tuloksen julkistamista, tiettyjen 'kelpoisuuskriteerien' on täytyttävä.

Älä missaa Explained | Kuinka COVID-19-testi toimii

Jos taloudenhoitogeeni (RNaasi P) on positiivinen, positiivinen kontrolli on positiivinen, negatiivinen kontrolli on negatiivinen eikä näyte osoita PCR-positiivista tulosta, näyte julistetaan negatiiviseksi SARS-CoV-2-viruksen RNA:n suhteen. Jos PCR-tulos on positiivinen, potilaalla on COVID-19.

Jaa Ystäviesi Kanssa: