Selitetty: Miksi Covid-19:n Delta-variantti leviää nopeammin kuin muut kannat

Yhä useammat ihmiset, jotka ovat saaneet Covid-19:n Delta-variantin tartunnan, välittävät tartunnan muille ennen kuin he edes epäilevät olevansa sairaita.

Myyjä, joka käyttää kasvonaamaria varotoimenpiteenä koronavirusta vastaan, esittelee leluja myytävänä Fort Kochi Beachillä Kochissa, Keralassa, maanantaina 23. elokuuta 2021. (AP Kuva: R S Iyer)

Kun tiedemiehet joutuvat kilpailemaan aikaa vastaan ​​löytääkseen biologisen perustan taudin leviämiselle Delta variantti Covid-19:stä useat uudet tutkimukset ovat osoittaneet, että avainmutaatiot rokotteiden tehon heikkeneminen , ja potilaiden korkea tarttuvuus esi-oireisen vaiheen aikana ovat tärkeimpiä syitä nopeaan leviämiseen.

Viimeaikaiset epidemiologiset tutkimukset viittaavat siihen, että Delta-variantti (B.1.617.2) on vähintään 40 prosenttia tarttuvampi kuin Alfa-variantti, joka tunnistettiin ensimmäisen kerran Yhdistyneessä kuningaskunnassa vuoden 2020 lopulla. useita tutkimuksia rokotteen tehokkuus Delta-varianttia vastaan ​​on heikentynyt, joten täysin rokotetut henkilöt ovat myös alttiita rokotteelle. läpimurtoinfektiot .

WHO:n päällikkö Tedros Adhanom Ghebreyesus sanoi lehdistötilaisuudessa aiemmin, että Delta on tarttuvin toistaiseksi tunnistettu muunnos, ja siitä on tulossa nopeasti. hallitseva Covid-19-kanta monissa maissa. Yhdysvaltain tautien valvonta- ja ehkäisykeskuksessa (CDC) levitetyn sisäisen esityksen mukaan Delta-variantti on tarttuvampi kuin virukset, jotka aiheuttavat MERS-, SARS-, Ebola-, flunssa-, kausi-influenssa- ja isorokkoa, ja se on vähintään yhtä tarttuvaa kuin vesirokko.

Lähde: JHU CSSE ja covarants.org

Miksi Delta-variantti on tarttuvampi?

Viimeaikaiset tutkimukset viittaavat siihen, että avainaminohappomutaatio voi olla Delta-variantin rajun tarttuvuuden takana.

Texasin yliopiston lääketieteellisen haaran virologi Pei-Yong Shin johtama tutkijaryhmä on nollannut keskeisen mutaation, joka muuttaa yhtä aminohappoa SARS-CoV-2-piikkiproteiinissa. Muutosta kutsutaan nimellä P681R, ja se muuttaa proliinijäännöksen arginiiniksi Nature-lehdessä julkaistun tutkimuksen mukaan. Muutos tapahtuu piikkiproteiinin furiinin pilkkoutumiskohdassa.

Jotta SARS-CoV-2-piikkiproteiini tunkeutuu soluihin, isäntäproteiinien on leikattava se kahdesti. Furiinin pilkkoutumiskohta Covid-19:ssä on merkittävä, koska se tarkoittaa, että isäntäentsyymit, mukaan lukien furiini, voivat tehdä ensimmäisen leikkauksen. Tämän jälkeen infektoituneesta solusta tulee esiin vasta muodostuneita viruspartikkeleita, jotka voivat infektoida isäntäsoluja tehokkaammin.

Alfa-variantissa on myös mutaatio samassa paikassa, vaikka se sisältää muutoksen eri aminohapossa. Tutkimuksessa todetaan, että Deltan tapauksessa furiinin pilkkoutumista muuttavalla mutaatiolla on ollut syvällinen vaikutus.

Hiljattain julkaistussa tutkimuksen ennakkojulkaisussa tutkijat totesivat, että piikkiproteiini leikataan paljon tehokkaammin Delta-varianttihiukkasissa kuin Alphassa, sillä P681R-mutaatio on suurelta osin vastuussa piikin tehokkaasta leikkaamisesta.

Tutkimuksessa todetaan, että P681R-mutaatiolla on avain Delta-variantin korkeaan tarttuvuuteen ja nopeaan leviämiseen. Tutkijat havaitsivat, että tartunnan saaneissa viljellyissä ihmisen hengitysteiden epiteelisoluissa Delta-variantit leviävät nopeammin kuin Alpha. Mutta kun tutkijat poistivat P681R-mutaation, ero lähetysnopeuksissa hävisi.

Tutkimus toistaa Tokion yliopiston virologi Kei Saton johtaman tutkimusryhmän tekemän tutkimuksen, jossa todettiin, että P681R:n kantavat piikkiproteiinit voivat fuusioitua infektoitumattomien solujen plasmakalvojen kanssa lähes kolme kertaa nopeammin kuin jos mutaatio puuttuu.

Lähde: CoVariants.org ja GISAID Our World in Datan kautta

Ovatko muut keskeiset mutaatiot vastuussa myös Deltan nopeasta leviämisestä?

Tutkijat ovat sanoneet, että Delta-variantissa on useita keskeisiä mutaatioita ja P681R-muutos, vaikka se on merkittävä, ei todennäköisesti ole ainoa syy, joka edistää sen nopeaa leviämistä.

Ugandan tutkijat sanoivat, että P681R-muutos esiintyi muunnelmassa, joka levisi laajasti maassa vuoden 2021 alussa, mutta se ei ole osoittautunut yhtä tarttuvaksi kuin Delta. The Kappa variantti Deltan sisaruksella, joka tunnistettiin Intiassa, oli myös sama mutaatio, mutta tutkijat ovat havainneet, että sen piikkiproteiini pilkkoutuu harvemmin ja fuusioituu solukalvoihin vähemmän tehokkaasti.

Aiemmat tutkimukset ovat osoittaneet, että muut Delta-variantin keskeiset mutaatiot, kuten L452R ja D6146, mahdollistavat viruksen kiinnittymisen tiukemmin reseptorisoluihin ja pakenevat immuniteetista helpommin.

Itse asiassa Delta-variantissa on useita mutaatioita piikkiproteiinin S1-alayksikössä, mukaan lukien kolme reseptoria sitovassa domeenissa, mikä parantaa sen kykyä sitoutua ACE2-reseptoreihin ja kiertää kehon immuunijärjestelmää.

Mielestäni virus menestyy volyymin ja nopeuden suhteen. Siitä on tullut paljon tehokkaampi virus. Se kulkee ihmisten ja solujen läpi paljon nopeammin, Cornellin yliopiston virologi Gary Whittaker kertoi Naturelle.

Whittaker sanoi lisäksi, että tutkimus on korostanut mutaatioiden merkitystä koronaviruksen furiinin pilkkoutumiskohdassa. Hän lisäsi myös, että P681R ei ole viimeinen huolta aiheuttava furiinin katkaisukohdan mutaatio.

Lähde: CoVariants.org ja GISAID Our World in Datan kautta

Miksi Delta-version leviämisen estäminen on niin vaikeaa?

Yksi muista syistä Delta-variantin nopeaan leviämiseen, kuten Kiinan Guangzhoussa tehdyssä tutkimuksessa todettiin, on potilaiden erittäin korkea tarttuvuus jopa esi-oireita edeltävässä vaiheessa. Tämä tarkoittaa, että ihmiset ovat vaarassa levittää viruksen jo ennen kuin he epäilevät saaneensa tartunnan.

Hongkongin yliopiston epidemiologin Benjamin Cowlingin ja hänen kollegoidensa hiljattain tekemässä tutkimuksessa havaittiin, että ihmisillä alkoi olla oireita 5,8 päivää Delta-tartunnan jälkeen – 1,8 päivää sen jälkeen, kun he olivat ensimmäisen kerran positiivisia viruksen RNA:lle. Tämä jättää siis vaarallisen ikkunan viruksen leviämiselle.

Toisin sanoen, koska oireet alkavat myöhemmin, useammat Delta-variantilla tartunnan saaneet ihmiset todennäköisesti välittävät tartunnan muille jo ennen kuin he edes epäilevät olevansa sairaita.

Tutkimuksessa havaittiin, että 74 % Delta-tartunnoista tapahtui oireita edeltävän vaiheen aikana. Tutkijat havaitsivat myös, että Deltan R-naught eli lisääntymisen perusluku, joka edustaa keskimäärin sitä ihmisten määrää, jonka yhden tartunnan saaneen henkilön voidaan olettaa levittävän kyseistä tautia, on Deltan osalta 6,4. Asioiden perspektiiviksi katsomiseksi Wuhan-kannan R-nyhmä oli useiden aiemmin tehtyjen tutkimusten mukaan välillä 2-4.

Onko Delta-rokotteen tehon heikkeneminen huolenaihe?

Useat tutkimukset ovat osoittaneet, että rokotteiden tehokkuus heikkenee Delta-varianttia vastaan, mikä puolestaan ​​jättää täysin rokotetut yksilöt alttiiksi läpimurtoinfektioille.

Public Health Englandin aikaisemmassa tutkimuksessa havaittiin, että Oxford-AstraZeneca-rokotteen tehokkuus johtuu 64 % Delta-varianttia vastaan . Aiemmin The Lancet -lehdessä julkaistussa tutkimuksessa havaittiin myös, että Pfizer-rokotteella täysin rokotetuilla on todennäköisesti yli viisi kertaa alhaisemmat neutraloivien vasta-aineiden tasot Delta-varianttia vastaan ​​verrattuna alkuperäiseen kantaan.

Viime aikoina Israelin terveysministeriön tiedot osoittivat, että kaksi Pfizer-laukausta tarjoavat 64 % suojan Covidia vastaan ​​aikana, jolloin yli 90 prosenttia maassa ilmoitetuista tapauksista johtui Delta-variantista.

Toinen huolenaihe on rokotteiden tehon heikkeneminen ajan myötä. Ison-Britannian Oxfordin yliopiston ja maan tilastotoimiston tutkijat havaitsivat tuoreessa tutkimuksessa, että Pfizer-rokotteen tehokkuus laski 90 prosenttiin kuukaudessa toisen annoksen ottamisen jälkeen, 85 prosenttiin kahden kuukauden jälkeen ja 78 prosenttia kolmen jälkeen. AstraZenecalle tarjottu vastaava suoja oli 67, 65 ja 61 prosenttia.

Tutkimuksessa havaittiin myös, että jopa täysin rokotetuilla ihmisillä Delta-variantin aiheuttamat infektiot tuottivat huippuviruksen kuormituksen, joka oli samanlainen kuin rokottamattomilla henkilöillä. Yhdysvalloissa ja Singaporessa tehdyt tutkimukset ovat tuottaneet samanlaisia ​​tuloksia.

Tämä tarkoittaa, että suurin huolenaihe on se, että jopa täysin rokotetut ihmiset voivat levittää Delta-varianttia, mikä tekee tartuntaketjun katkaisemisesta erittäin vaikeaa.

CDC:n tässä kuussa julkaiseman raportin mukaan Provincetownin rantakaupungissa Massachusettsissa pidettyjen suurten kokoontumisten jälkeen osavaltiossa raportoitiin 469 Covid-19-tapausta, joista lähes kolme neljäsosaa oli rokotettujen ihmisten joukossa.

Analyysissä todettiin, että kuten rokottamattomilla, myös pistoksen saaneilla oli korkea Ct-arvot , mikä viittaa korkeaan viruskuormaan. 133 näytteen genomin sekvensoinnin jälkeen 90 % tapauksista havaittiin johtuvan Delta-variantista. Löydösten johdosta CDC päivitti 27. heinäkuuta ohjeistuksensa jälleen ja suositteli ja jopa rokotettujen ihmisten tulisi käyttää maskeja alueilla, joilla Covid-19-tartunta on huomattava ja korkea.

Jaa Ystäviesi Kanssa: