Selitetty: Mikä on 'CT-arvo' Covid-19-testissä ja miksi se on tärkeää?

Syklin kynnysarvo selviää koronaviruksen RT-PCR-testeissä, ja se määrittää, onko henkilö Covid-19-positiivinen vai ei. Missä määrin se korreloi viruskuorman ja taudin vaikeusasteen kanssa?

RT-PCR-testi havaitsee viruksen; Ct-arvo määrittää vertailuarvon sille, lasketaanko henkilö positiiviseksi. (Express Photo: Amit Mehra)

Eri tieteellisistä termeistä, joista Covid-19-pandemia on tullut osaksi julkista sanastoa, yksi on 'Ct-arvo' RT-PCR-testeissä sen määrittämiseksi, onko potilas Covid-19-positiivinen.

Tämä oli aiheena äskettäin Maharashtran hallituksen Intian lääketieteellisen tutkimuksen neuvostolle (ICMR) lähettämässä pyynnössä. Valtio haki selvyyttä, kannattaako henkilöä kohdella Covid-negatiivisena, jos Ct-arvo on yli 24 ja henkilö on oireeton. Valtion virkamiehet sanoivat, että useissa ICMR-asiakirjoissa oli mainittu erilaisia ​​​​Ct-arvoja, ja jopa Niti Aayogin ja National Center for Disease Control -keskuksen välillä oli erilaisia ​​​​näkemyksiä.

Päiviä myöhemmin ICMR:n pääosasto kirjoitti takaisin valtion terveysministerille, että ICMR on ottanut tietoja virologialaboratorioista eri puolilla maata saavuttaakseen yhden Ct-arvon rajan. Kaikkia potilaita, joiden Ct-arvo on alle 35, voidaan pitää positiivisina, kun taas niitä, joiden Ct-arvo on yli 35, voidaan pitää negatiivisina, ICMR sanoi.

Mutta mikä on Ct-arvo?

Lyhenne sanoista syklin kynnys, Ct on arvo, joka tulee esiin RT-PCR-testien aikana, kultainen standardi SARS-CoV-2-koronaviruksen havaitsemisessa. RT-PCR-testissä RNA uutetaan potilaasta kerätystä vanupuikosta. Sitten se muunnetaan DNA:ksi, joka sitten monistetaan. Amplifikaatiolla tarkoitetaan prosessia, jossa luodaan useita kopioita geneettisestä materiaalista - tässä tapauksessa DNA:sta. Tämä parantaa testin kykyä havaita viruksen esiintyminen. Monistaminen tapahtuu jaksojen sarjan kautta - yhdestä kopiosta tulee kaksi, kahdesta neljä ja niin edelleen - ja useiden jaksojen jälkeen syntyy havaittava määrä virusta.

ICMR-ohjeen mukaan RT-PCR-reaktion Ct-arvo on niiden syklien lukumäärä, joissa PCR-tuotteen fluoresenssi on havaittavissa taustasignaalin lisäksi. Yksinkertaisesti sanottuna Ct-arvo viittaa jaksojen lukumäärään, jonka jälkeen virus voidaan havaita. Jos tarvitaan suurempi määrä jaksoja, se tarkoittaa, että virus jäi havaitsematta, kun jaksojen määrä oli pienempi. Mitä pienempi Ct-arvo, sitä suurempi viruskuorma – koska virus on havaittu harvempien jaksojen jälkeen.

Uutiskirje| Napsauta saadaksesi päivän parhaat selitykset postilaatikkoosi

Miksi CT-arvo on tärkeä?

Tarkastellaanpa asiaa ICMR:n neuvoja ja Maharashtran kirjettä ICMR:lle. ICMR:n mukaan potilas katsotaan Covid-positiiviseksi, jos Ct-arvo on alle 35. Toisin sanoen, jos virus on havaittavissa 35 syklin jälkeen tai aikaisemmin, potilas katsotaan positiiviseksi. Jos vertailuarvoa laskettaisiin 24:ään – Maharashtran kirjeessä mainittuun arvoon – se tarkoittaisi, että Ct-arvoja välillä 25–34 ei pidettäisi positiivisina. Vertailuarvo 35 tarkoittaa siis sitä, että enemmän potilaita pidettäisiin positiivisina kuin mitä saisimme, jos vertailuarvo olisi 24. ICMR on sanonut, että Ct-kynnysparametrin alentaminen voi johtaa useiden tarttuvien henkilöiden puuttumiseen.

Ct-arvoa voidaan ajatella tarttumispotentiaalin mittana, sanoi johtava virologi tohtori Shahid Jameel. Joten jos kurkussani ja nenässäni on enemmän virusta, välitän sen paremmin, sanoi tohtori Jameel, joka on Ashokan yliopiston Trivedi School of Biosciences -koulun johtaja.

Mikä on ICMR-kynnyksen 35 merkitys?

Maailmanlaajuisesti hyväksytty Ct-arvon raja-arvo Covid-19:lle vaihtelee välillä 35–40, riippuen vastaavien testauslaitteiden valmistajien ohjeista. ICMR on saavuttanut Ct-arvon 35 perustuen laboratoriokokemuksiin ja useista virologialaboratorioista saatuihin tietoihin.

Uusia neuvoja ei ollut, mutta ICMR ilmoitti Maharashtran hallitukselle, että ei ole suositeltavaa käyttää alemman syklin kynnysparametria, koska se johtaisi useiden tartuntatauttien katoamiseen ja lisää taudin leviämistä, tohtori Balram Bhargava, ICMR:n pääosasto, sanoi.

Onko Ct-arvon ja sairauden vakavuuden välillä korrelaatiota?

Ei. Vaikka Ct-arvo korreloi käänteisesti viruskuorman kanssa, sillä ei ole mitään vaikutusta taudin vakavuuteen, asiantuntijat ovat sanoneet. Potilaalla voi olla alhainen Ct-arvo, mikä tarkoittaa, että hänen viruskuormituksensa on riittävän suuri, jotta se voidaan havaita nopeasti, mutta hän voi silti olla oireeton.

Pienessä tutkimuksessa, joka julkaistiin Indian Journal of Medical Microbiology -lehdessä tämän vuoden tammikuussa, havaittiin, ettei Ct-arvojen ja Covid-19-tautia sairastavien potilaiden sairauden vaikeuden tai kuolleisuuden välillä ollut korrelaatiota. Se havaitsi, että oireiden alkamisesta kuluvalla ajalla on vahvempi yhteys Ct-arvoihin verrattuna taudin vakavuuteen.

Ct-arvo kertoo meille viruskuormasta kurkussa, ei keuhkoissa, sanoi tohtori Parikshit Prayag, Punen Deenanath Mangeshkarin sairaalan tartuntatautikonsultti. Ct-arvo ei korreloi vakavuuden kanssa - vain tarttuvuuden kanssa. Ensimmäisessä raportissa en todellakaan katso Ct-arvoa, mutta sairaalassa olevien potilaiden seurannassa otan huomioon Ct-arvon, koska silloin voin päättää, siirränkö potilaan ei-Covid-rakennukseen vai en. . Tartunnan kannalta sillä voi olla merkitystä, ei vakavuutta, tohtori Prayag sanoi.

Tarkoittaako korkea Ct-arvo aina alhaista viruskuormaa?

Vaikka tämä saattaa olla ilmeinen päätelmä, jotkut asiantuntijat korostavat, että joillakin potilailla voi olla korkea Ct-arvo ja silti erittäin merkittävä Covid-19-infektiotaso ja päinvastoin. Monet tekijät ovat tärkeitä RT-PCR-testin tulkinnassa, ja tulokset voivat myös riippua näytteenottomenetelmästä ja tartunnasta keräämiseen ja analyysiin kuluvasta ajasta.

ICMR:n viime vuoden elokuussa antamassa neuvolassa todettiin, että Ct-arvot riippuvat siitä, miten näyte on kerätty. Huonosti kerätty näyte voi heijastaa sopimattomia Ct-arvoja. Lisäksi Ct-arvot määräytyvät myös testin suorittajan teknisen pätevyyden, laitteiden kalibroinnin ja tulkkien analyyttisten taitojen perusteella.

Jälleen Ct-arvot voivat vaihdella samalta yksilöltä kerättyjen nenä- ja suunnielun näytteiden välillä. Kuljetuslämpötila sekä aika, joka kuluu keräyksestä laboratorioon, voivat myös vaikuttaa haitallisesti Ct-arvoihin.

Jaa Ystäviesi Kanssa: