Selitetty: Mitkä ovat Covid-19-muunnelmat Intiassa, ja selittävätkö ne nousun?

Yli 320 koronavirusnäytteestä on löydetty Punjabissa Yhdistyneen kuningaskunnan jälkeläisiä. Selittääkö tämä viimeaikaisen nousun? Ja kuinka yleisiä ovat Etelä-Afrikan ja Brasilian muunnelmat muiden lisäksi Intiassa?

Punen ostoskeskuksessa (Express Photo: Ashish Kale, File)

Punjabista on löydetty yli 320 koronavirusnäytettä Yhdistyneen kuningaskunnan sukulinjaa , viittaus uuteen viruskantaan, joka oli ilmaantunut Isossa-Britanniassa joulukuussa ja jonka geneettiset mutaatiot ovat mahdollistaneet sen nopeamman leviämisen. Tämä on Yhdistyneen kuningaskunnan muunnelman yleisin esiintyminen Intian väestössä tähän mennessä, ja se saattaa selittää tapausten nopean nousun Punjabissa viime viikkoina.

Uutiskirje| Napsauta saadaksesi päivän parhaat selitykset postilaatikkoosi

Hallituksen keskiviikkona antaman lausunnon mukaan 736 näytteestä eri puolilta maata on todettu olevan Yhdistyneessä kuningaskunnassa. Näiden lisäksi 34 näytteellä havaittiin olevan Etelä-Afrikan jälkeläisiä ja yhdellä brasilialaista syntyperää. Eteläafrikkalaiset ja brasilialaiset variantit ovat kaksi muuta hallitsevaa koronaviruksen kantaa, jotka kiertävät ympäri maailmaa. Näiden kahden muunnelman geneettiset mutaatiot tekevät niistä todennäköisemmin pakenemassa ihmisen immuunijärjestelmästä. Sen vuoksi pelätään, että nykyiset rokotteet saattavat olla verrattain vähemmän tehokkaita niitä vastaan, vaikka asiaa tutkitaan edelleen.

Vaihtoehdot Intiassa

Yhdistyneen kuningaskunnan, Brasilian ja Etelä-Afrikan muunnelmat eivät ole ainoita, joita tällä hetkellä liikkuu Intian väestössä. Kuten kaikki muut organismit, myös koronavirus mutatoituu jatkuvasti, ja sen geneettisessä rakenteessa tapahtuu muutoksia jokaisessa replikaatiosyklissä. Useimmat näistä mutaatioista ovat merkityksettömiä eivätkä muuta koronaviruksen yleistä luonnetta tai käyttäytymistä. Mutta muutamat niistä, mahdollisesti yksi tuhansista, voivat saada aikaan tärkeitä muutoksia, jotka auttavat virusta sopeutumaan tai selviytymään paremmin.

Epidemian aikana seurataan kolmenlaisia ​​muutoksia - sellaisia, jotka lisäävät viruksen leviämiskykyä nopeammin, sellaisia, jotka aiheuttavat tartunnan saaneelle vakavamman sairauden ja sellaisia, jotka auttavat virusta pakenemaan immuunivasteesta.

Yhdistyneen kuningaskunnan, Brasilian ja Etelä-Afrikan muunnelmat ovat tällaisia ​​kantoja. Jokaisella heistä on nyt omat perheensä, mikä tarkoittaa, että näissä on ollut monia myöhempiä mutaatioita, mutta alkuperäinen määrittävä mutaatio on säilynyt ehjänä. Nämä kolme muunnelmaperhettä tai sukulinjaa on löydetty useista maista, ja ne ovat pääasiassa vastuussa tapausten noususta Euroopassa ja Brasiliassa.

Näiden lisäksi Intian väestössä kiertää useita muita muunnelmia, sellaisia, joilla on syntyi paikallisesti sekä muut, jotka matkustajat ovat tuoneet ulkomailta. Mutta mitään näistä ei ole luokiteltu huolenaiheeksi.

Covid-19-variantteja havaittu Intiassa

Iso-Britannian Covid-19-variantti ja huolenaiheet

Tutkijat ovat väittäneet, että mikään kolmesta 'huolenaiheesta' - Yhdistynyt kuningaskunta, Brasilia tai Etelä-Afrikka - ei liity tapausten nykyiseen lisääntymiseen Intiassa. Niiden esiintyvyys yhteisössä ei ole tällä hetkellä niin korkea, että nykyinen nousu voisi johtua niistä.

Jopa Punjabissa, jossa 80 % analysoidusta 400 näytteestä osoittautui Yhdistyneen kuningaskunnan muunnelmaksi, on liian aikaista syyttää sitä tapausten poikkeuksellisesta lisääntymisestä viime viikkoina. Genomisekvensoinnin tulokset on nyt paljastettu, ja kliininen korrelaatio on tehtävä sen arvioimiseksi, ovatko ne vastuussa tapausten lisääntymisestä.

Kuten tiedemiehet ovat huomauttaneet, jos UK-kannan saaneet ihmiset Punjabissa ovat kaikki matkustajia tai heidän suoria kontaktejaan, heidän esiintymisensä voidaan helposti selittää, eivätkä ne aiheuta suurta huolta. Kuitenkin, jos sitä on löydetty ihmisiltä laajemmassakin yhteisössä, on olemassa vaara, että se leviää muihinkin hyvin nopeasti. Se merkitsisi myös sitä, että osavaltiossa noudatettavia eristys- ja karanteenimenettelyjä erityisesti matkustajien osalta ei ole noudatettu kovin tiukasti.

Muutama spesifinen UK-kannasta löydetty mutaatio, kuten yksi nimeltään E484Q ja toinen nimeltään N440K, on ​​havaittu myös joissakin muissa muunnelmissa, ja nämä ovat kiertäneet Intian väestössä useita kuukausia. Tällä hetkellä ei ole näyttöä siitä, että jompikumpi näistä olisi voinut johtaa toiseen nousuun tai aiheuttaa uudelleeninfektion potilaissa.

Kuitenkin paljon yksityiskohtaisempia tieteellisiä tutkimuksia tarvitaan arvioimaan niiden vaikutusta taudin leviämiseen Intiassa.

Genomin sekvensointi…

Intiassa on toiseksi eniten koronavirustartunnan saaneita ihmisiä epidemian aikana. Mutta se on tehnyt hyvin vähän genomisekvenssejä liikkeessä olevista eri varianteista. Tähän mennessä se on tehnyt geenianalyysin 19 092 näytteestä eri puolilta maata hallituksen viime viikolla eduskunnassa antaman lausunnon mukaan. Tämä sisältää 10 787 näytteen sekvensoinnin sen jälkeen, kun hallitus perusti INSACOGin (Intian SARS-CoV2 Consortium on Genomics) joulukuussa nimenomaan tätä tarkoitusta varten. Monet muut maat, mukaan lukien Yhdysvallat ja Kiina, ovat analysoineet yli 100 000 geenisekvenssiä.

Organismin geneettisten muutosten tutkiminen on tärkeitä vihjeitä viruksen alkuperän, leviämisen ja vaikutuksen potilaisiin ymmärtämiseen. INSACOGin tavoitteena on sekvensoida näytteet vähintään 5 %:sta kaikista tartunnan saaneista tapauksista kymmenen laboratorion verkoston kautta. Se näyttää tällä hetkellä erittäin suurelta tilaukselta. Intiassa on toistaiseksi kirjattu yli 1,17 miljoonaa positiivista tapausta. Tähän mennessä sekvensoituneet 19 092 näytettä muodostavat vain 0,16 % tästä määrästä.

LIITY NYT :Express Explained Telegram -kanava

…ja miksi se on ollut hidasta

Yksi suurimmista syistä genomin sekvensoinnin hitaan on ollut varojen puute. Toistaiseksi INSACOGille ei ole myönnetty rahaa, vaikka virkamiehet sanoivat, että varojen hyväksymistä odotetaan nyt minä päivänä tahansa. Laboratoriot ovat käyttäneet sekvensointityöhön oman vuosibudjettinsa varoja. Yhden näytteen geenisekvenssin erottaminen kestää 3 000–5 000 rupiaa. Kustannukset muodostuvat pääasiassa prosessissa tarvittavista kemiallisista reagensseista.

Osavaltiot eivät myöskään ole aktiivisesti lähettäneet näytteitään laboratorioihin sekvensointia varten. Maharashtra, joka on toistaiseksi rekisteröinyt yli 25 000 000 tartuntaa, on lähettänyt vain noin 2 800 näytettä sekvensointiin parlamentissa esitettyjen hallituksen tietojen mukaan. Se on vain noin 0,11 % kaikista tapauksista. Kerala on lähettänyt eniten näytteitä sekvensointiin, noin 5 200, mutta Karnataka, jolla on vastaava määrä tapauksia, on lähettänyt vain 137 näytettä. Näin alhainen genomin sekvensointiaste ei välttämättä ole tilastollisesti merkitsevä, jotta voidaan tehdä johtopäätöksiä viruksen muuttuvasta luonteesta ja käyttäytymisestä tai suunnitella sopivia toimia epidemian leviämisen hillitsemiseksi.

Tämä artikkeli ilmestyi ensimmäisen kerran painetussa painoksessa 25. maaliskuuta 2021 otsikolla 'Cracking the virus strain'.

Jaa Ystäviesi Kanssa: