Selitetty: Mikä on Delta-variantin uusi AY.12-alalinja, ja pitäisikö sinun olla huolissaan?

Delta-variantti (B.1.617.2) on synnyttänyt useita alalinjoja, joita kutsutaan 'Delta Plus' -varianteiksi ja jotka sisältävät suurimman osan sille ominaisista mutaatioista, mutta ovat muilta osin erilaisia. Yhdellä näistä alalinjoista, AY.12, on kaikki tyypilliset Delta-mutaatiot yhtä lukuun ottamatta.

Ihmiset seisovat jonossa saadakseen annoksen Covid-19-rokoteta väliaikaisessa rokotuskeskuksessa, joka on perustettu koulun sisään Mumbaissa, tiistaina 17. elokuuta 2021. (PTI Photo/Kunal Patil)

Kun maailma seuraa hermostuneesti kaikkia uusia Covid-19-variantteja ja sen alalinjoja, jokainen virusnäyte on teknisesti uusi 'variantti', koska sen sekvenssi ei vastaa minkään muun viruksen sekvenssiä.

Nyt tutkijat ovat laajentaneet Delta-perhettä neljästä 13 muunnelmaan. Jotkut tapaukset Delta variantti , Intiassa yleisin huolenaihe, luokitellaan uudelleen toiseen alalinjaan - AY.12 -, joka on liitetty lukuisiin tapauksiin Israelissa, Intian SARS-CoV-2 Genome (INSACOG) -konsortioon, joka seuraa uusia muunnelmia, sanoi raportissa.

Koska AY.12-määritelmä on kuitenkin epäjohdonmukainen, lopulliset luvut vievät jonkin aikaa, konsortion lausunnossa lukee.

Joten mikä tämä AY.12-mutaatio on?

Pohjimmiltaan virusevoluutio toimii kuten mikä tahansa muu. Kun virus leviää kehon läpi, se tekee itsestään kopioita, joissa on usein pieniä virheitä ja muutoksia.

Sellaisenaan Delta-variantti (B.1.617.2) on synnyttänyt useita alalinjoja, joita kutsutaan Delta Plus -varianteiksi ja joissa on suurin osa sille ominaisista mutaatioista, mutta jotka ovat erilaisia ​​muilla tavoin. Yhdellä näistä alalinjoista, AY.12, on kaikki tyypilliset Delta-mutaatiot yhtä lukuun ottamatta.

Tapausten piikki Israelissa on huolestuttava, koska se on maa, jossa lähes 60 prosenttia aikuisista on täysin rokotettuja, ja raportoi, että Pfizer-rokotteen tehokkuus kyseisessä maassa on huomattavasti pienempi kuin kliinisissä tutkimuksissa havaittu. Uudelleenluokituksen tarkoituksena on ensisijaisesti auttaa mikroepidemiologiaa, eikä se perustu merkittävien mutaatioiden hankkimiseen. Näin ollen ei tällä hetkellä tiedetä, onko AY.12 kliinisesti erilainen kuin Delta, INSACOG-raportti huomautti. Piikkiproteiinissa (S) ei havaita uusia huolta aiheuttavia mutaatioita. Sen nopea kasvu Israelissa tarkoittaa kuitenkin sitä, että sitä pitäisi tarkastella tarkemmin.

Onko AY.12:n ja muiden kantojen välillä eroa?

INSACOG:n mukaan ei vielä tiedetä, onko AY.12 kliinisesti erilainen kuin Delta tai B.1.617.2.

AY.12 on kuitenkin menettänyt osan Delta-linjassa havaituista mutaatioista, kuten G142D:n piikkiproteiinissa. Tämän variantin piikkiproteiinissa ei havaita uusia huolta aiheuttavia mutaatioita.

AY.12 on tällä hetkellä hallitsevin kanta Israelissa – 51 prosenttia tutkituista näytteistä on osoittanut tämän muunnelman esiintyvyyden. Intialaisten tutkimusryhmien GISAIDiin tähän mennessä lataamien sekvenssien lukumäärän perusteella tämän variantin esiintyvyys on viime viikon aikana noussut yli 20 prosenttiin.

INSACOG pyysi osavaltioita noudattamaan varovaisuutta ja tarkkailemaan tätä varianttia, mutta sanoi: AY.12, Deltan uudelleen osoitettu alalinja nähdään monissa osavaltioissa, mutta numeroita on tarkasteltava tarkemmin. Deltan ja AY.12:n välisten muutosten toiminnallista vaikutusta ei tunneta, mutta nämä kaksi näyttävät olevan hyvin samankaltaisia ​​molekyylitasolla.

Tähän mennessä INSACOGin mukaan noin 70 000 koronavirusnäytettä on sekvensoitu genomisen rakenteen perusteella, joista 50 000 on jaettu eri sukupolville. Noin 60 % niistä koostuu kansainvälisistä huolenaiheista tai kiinnostavista muunnelmista (VoC tai VoI), joita seurataan maailmanlaajuisesti ja jotka liittyvät epidemioihin sekä rokotteiden läpimurto- ja uudelleeninfektiotapauksiin. Näissä VoC:ssa Delta-variantti käsittää 70 % näytteistä. Delta plus -tapaukset, joihin sisältyy AY.12, ovat vain 67, vaikka tämän odotetaan turpoavan uudelleenluokituksen jälkeen.

Evoluutiota seurataan

Outbreak.org, joka seuraa uusia variantteja ja niiden esiintyvyyttä, kertoo, että ensimmäinen AY.12-sukulinjan tapaus kirjattiin 7. syyskuuta 2020. Sen jälkeen 44 083 AY.12-linjan sekvenssiä on havaittu eri puolilla maailmaa elokuuhun asti. 26.

Variantti nousi kuitenkin etualalle sen jälkeen, kun siitä tuli hallitseva kanta Israelissa. Neljäs tartuntaaalto lähestyy nopeasti Israelin pandemian pahimpien päivien tasoa viime talvena. Päivittäinen vahvistettujen uusien virustapausten määrä on yli kaksinkertaistunut viimeisen kahden viikon aikana, mikä tekee Israelista nousevan kuuman paikan kansainvälisillä listoilla. Kokoontumisrajoitukset sekä kaupallisten ja viihdepaikkojen rajoitukset palautettiin tällä viikolla, ja hallitus harkitsee uutta sulkua.

Useimmat asiantuntijat ovat kuitenkin huolissaan siitä, että Israelin korkea infektioiden määrä varhaisten rokotusten saajien keskuudessa saattaa viitata rokotteen suojan heikkenemiseen ajan myötä. Tämä havainto vaikutti USA:n päätökseen tarjota tehosterokotuksia amerikkalaisille laajalti ensi alusta alkaen. kuukausi. Rokote saattaa olla vähemmän tehokas estämään erittäin tarttuvan A.12 Delta -variantin infektio, joka on nyt viruksen ensisijainen versio Israelissa.

Israelin terveysministeriön heinäkuun lopulla julkaisemat tiedot viittaavat siihen, että Pfizer-rokotteen teho oli vain 39 % estämään infektioita maassa kesäkuun lopulla ja heinäkuun alussa, kun se tammi-huhtikuun alussa oli 95 %. Molemmilla jaksoilla pistos oli kuitenkin yli 90 % tehokas vakavan sairauden ehkäisyssä. Sellaisenaan Israel kiinnittää nyt toiveensa tehosteisiin.

Outbreak.org:n mukaan ensimmäinen näyte AY.12:sta Intiassa on peräisin 7.9.2020.

INSACOG on toistaiseksi sekvensoinut 67 699 viruksen näytettä Intiasta, joista 50 869 on analysoitu yksityiskohtaisesti. Osavaltioiden hallitukset ovat jakaneet vielä 11 016 näytesarjaa, jolloin sekvensoitujen näytteiden kokonaismäärä on 78 865.

Huolestuttava trendi on kuitenkin se, että Intiassa on tähän mennessä saanut tartunnan yli 3,2 miljoonaa ihmistä, joten vain noin 0,002 % näytteistä on sekvensoitu tähän mennessä.

Mitä väliä tavalliselle ihmiselle?

Kaikki vaihtoehdot, jotka Maailman terveysjärjestö on tunnustanut, eivät ole yhtä huonoja. Kun organisaatio antaa uudelle perheelle nimen, se lisää myös tarran, joka kertoo, kuinka huolissamme meidän pitäisi olla.

Alin taso on kiinnostava variantti, joten sitä kannattaa pitää silmällä. Keskellä on huolenaihe, kuten Delta, joka on kehittynyt vaarallisemmaksi. Usein kiinnostaville muunnelmille annetaan tämä merkki, koska niillä on yhteinen mutaatio huolenaiheiden muunnelmien kanssa – niitä valvotaan. CDC:llä on ylimääräinen, vakavampi luokka, suuren seurauksen variantti, jota ei ole koskaan annettu Covid-perheelle. Se on varattu mahdollisille tuleville kannoille, jotka voivat aiheuttaa vakavia sairauksia rokotetuille ihmisille, jotka eivät näy yleisesti käytetyissä diagnostisissa testeissä tai ehkä vastustavat useita covid-oireiden hoitoja.

Mutaatiot tapahtuvat satunnaisesti virusgenomeissa kaikilla miljoonilla tartunnan saaneilla ihmisillä. Jotkut näistä mutaatioista kuolevat pois ja muutamat leviävät muihin ihmisiin. Sellaisenaan tutkijat seuraavat tarkasti Deltan malleja, etenkin koska se leviää niin nopeasti.

Uutiskirje| Napsauta saadaksesi päivän parhaat selitykset postilaatikkoosi

Jaa Ystäviesi Kanssa: