Selitettiin: Kuinka nopeasti uusi koronaviruskanta leviää? Vaikuttaako se rokotuksiin?

Uusi koronaviruskanta Isossa-Britanniassa: Intia ja useat muut maat ovat keskeyttäneet lennot Isoon-Britanniaan ja sieltä pois. Mitkä mutaatiot ovat johtaneet huolta aiheuttaneeseen koronaviruksen varianttiin? Kuinka nopeasti se on levinnyt? Ja vaikuttaako se rokotuksiin?

Lennot Britanniasta on peruttu Cointrinin lentokentällä Genevessä, Sveitsissä, 21.12.2020. (Reuters Kuva: Denis Balibouse)

Maanantaina Intia keskeytti kaikki lennot Yhdistyneestä kuningaskunnasta ja Yhdistyneeseen kuningaskuntaan 31. joulukuuta asti, koska huolenaihe a uusi variantti SARS-CoV-2, joka leviää ja kasvaa siellä nopeasti. Myös useat muut maat ovat keskeyttäneet Ison-Britannian lennot ja asettaneet matkustusrajoituksia.

Mitä nämä huolenaiheet johtavat matkustusrajoituksiin?

Viime viikolla uusi SARS-CoV-2-variantti paljastui syynä Covid-19-tapausten nopeaan nousuun Etelä- ja Itä-Englannissa. Siihen viitataan nimellä VUI (Variant Under Investigation) 202012/01 tai B.1.1.7-linja.

Maailmanluokan genomisen kykyjemme ansiosta olemme viime päivinä tunnistaneet koronaviruksen uuden muunnelman, joka saattaa liittyä nopeampaan leviämiseen Etelä-Englannissa, Yhdistyneen kuningaskunnan terveysministeri Matt Hancock kertoi parlamentille. 14. joulukuuta. Yhdistyneen kuningaskunnan viranomaiset ovat jo ilmoittaneet vaihtoehdosta Maailman terveysjärjestölle.

Public Health England (PHE) ilmoitti, että 13. joulukuuta on tunnistettu 1 108 tämän muunnelman tapausta, pääasiassa Etelä- ja Itä-Englannissa. PHE työskentelee kumppaneiden kanssa tutkiakseen asiaa ja aikoo jakaa havainnot seuraavan kahden viikon aikana, se sanoi.

Millainen variantti on?

Variantin tunnisti genomivalvonnassa COVID-19 Genomics UK (COG-UK), konsortio, joka analysoi genomin sekvensointitietoja Isosta-Britanniasta. COG-UK on globaalin Covid-19-tietokannan GISAID suurin avustaja.

Variantti on seurausta useista mutaatioista uuden koronaviruksen SARS-CoV-2 piikkiproteiinissa sekä mutaatioista muilla RNA-viruksen genomialueilla. Alustava analyysi viittaa siihen, että se on tarttuvampi kuin aiemmin liikkeellä olleet muunnelmat. COG-UK tunnisti yhden näistä mutaatioista N501Y:ksi piikkiproteiinin alueella, joka sitoutuu ihmissolun avainproteiiniin, ACE2-reseptoriin. Tämä oli osoitus siitä, että muutokset voivat teoriassa johtaa viruksen tarttuvammaksi. Konsortio sanoi, että ponnisteluja ollaan vahvistamassa, edistääkö mikään näistä mutaatioista lisääntynyttä tartuntaa.

Mitä tiedämme toistaiseksi taudin tarttuvuudesta ja vakavuudesta?

Sunnuntaina PHE sanoi, että koko genomin sekvensoinnin, epidemiologian ja mallinnuksen tiedot viittaavat siihen, että uusi variantti tarttuu helpommin kuin muut kannat.

Se kuitenkin korosti myös, ettei ole todisteita siitä, että variantti aiheuttaisi todennäköisemmin vakavaa sairautta tai kuolleisuutta. … Mutta jatkamme tutkimuksia ymmärtääksemme tätä paremmin, se sanoi. Se sanoi, että kuolleisuus on jäljessä oleva indikaattori, ja se seuraa tätä jatkuvasti tulevina viikkoina.

PHE on sanonut, että se ei vielä tiedä tämän leviämisen lisääntymisen mekanismia. Tiedämme, että mutaatiot piikkiproteiinissa, viruksen osassa, joka tekee siitä tarttuvan, voivat muuttaa viruksen vuorovaikutusta ihmissolujen kanssa, se sanoi.

Se sanoi, että todisteet osoittavat, että tartuntaluvut maantieteellisillä alueilla, joilla tämä tietty kanta on kiertänyt, ovat lisääntyneet odotettua nopeammin, ja mallinnus on osoittanut, että tällä variantilla on suurempi välittymisnopeus kuin muilla nykyisen kierron muunnelmilla.

Uusi koronaviruskanta Isossa-Britanniassa: Poliisi ohjaa liikennettä suljetun lauttaterminaalin sisäänkäynnillä Doverissa Englannissa maanantaina Doverin sataman sulkemisen jälkeen. (AP kuva)

Kuinka paljon huolestuttavaa on suurempi tarttuvuus?

18. joulukuuta New and Emerging Respiratory Virus Threats Advisory Group (NERVTAG), joka neuvoo Yhdistyneen kuningaskunnan hallitusta uusien ja ilmaantuvien hengitystievirusten aiheuttamasta uhasta, sanoi, että uusi variantti voisi mahdollisesti lisätä taudin lisääntymislukua jopa 0,93:lla. . Se sanoi, että se luottaa kohtalaisesti siihen, että uusi versio osoittaa huomattavasti paremman siirrettävyyden muihin muunnelmiin verrattuna.

Asiantuntijaelin totesi kuitenkin, että tällä hetkellä ei ole riittävästi tietoa, jotta voitaisiin tehdä johtopäätöksiä lisääntyneen tarttuvuuden taustalla olevasta mekanismista, tapausten ikäjakaumasta ja taudin vakavuudesta. Se on sanonut, että neljä kuolemantapausta on tunnistettu noin 1 000 tapauksesta, mutta lisätyötä tarvitaan tämän kuolleisuuden vertaamiseksi vertailukelpoisiin tietokokonaisuuksiin.

Mutaatioiden sijainti piikkiglykoproteiinin reseptoria sitovassa domeenissa lisää sen mahdollisuuden, että tämä variantti on antigeenisesti erilainen kuin aikaisemmista varianteista. Neljä todennäköistä uudelleeninfektiota on tunnistettu 915 tämän muunnelman koehenkilön joukossa, mutta lisätyötä tarvitaan tämän uudelleeninfektiosuhteen vertaamiseksi vertailukelpoisiin tietokokonaisuuksiin, se sanoi.

Sunnuntaina Euroopan tautien ehkäisy- ja valvontakeskuksen julkaisemassa uhka-arvioinnissa kerrottiin, että fylogeneettinen analyysi paljastaa, että klusteri eroaa 29 nukleotidisubstituutiolla alkuperäisestä Wuhan-kannasta. Kolme sekvenssiä Tanskasta ja yksi Australiasta, marraskuussa 2020 kerätyistä näytteistä, klusterit Yhdistyneen kuningaskunnan variantin kanssa, mikä todennäköisesti viittaa kansainväliseen leviämiseen, vaikka laajuus on edelleen tuntematon, se sanoi.

Uusi koronaviruskanta Isossa-Britanniassa: Doverin satama suljetaan EU-maiden asettaessa matkustuskiellon Britanniasta. (Reutersin valokuva)

Mutta eikö virus ole mutatoitunut aiemmin?

Aina kun virus replikoituu ja kiertää ihmispopulaatiossa, mutaatioita tapahtuu luonnollisesti, noin yhdestä kahteen mutaatiota kuukaudessa maailmanlaajuisessa fysiologiassa.

Itse asiassa SARS-CoV-2:n osalta COG-UK sanoo, että piikkiproteiinissa on tällä hetkellä noin 4 000 mutaatiota. Variantti D614G oli aiemmin hallitseva kanta, koska se levisi hyvin helposti. Toinen espanjalaisilta maataloustyöntekijöiltä peräisin oleva kanta, 20A. EU1, levisi kesällä nopeasti ympäri Eurooppaa.

On vaikea ennustaa, onko jokin tietty mutaatio tärkeä, kun se ilmaantuu ensimmäisen kerran, kun taustalla on jatkuva uusien mutaatioiden ilmaantuminen. Niiden merkityksen ymmärtäminen voi olla mahdollista kokeellisen työn perusteella, joka osoittaa yhteyden mutaation ja virusbiologian hienovaraisen muutoksen välillä. Vaatii kuitenkin huomattavasti aikaa ja vaivaa monien tuhansien mutaatioyhdistelmien vaikutuksen testaamiseen, COG-UK sanoi.

Vaikuttaako se rokotteiden kehittämiseen ja vasteisiin?

Sunnuntaina Yhdistyneen kuningaskunnan viranomaiset sanoivat, että laboratoriotyötä tehdään ensisijaisesti tämän ymmärtämiseksi. Tällä hetkellä ei ole todisteita siitä, että Pfizer-rokote ei suojaa ihmisiä uudelta kannasta, PHE sanoi.

Jaa Ystäviesi Kanssa: