Selitetty: B.1.617-variantti ja Covid-19-huippu Intiassa

Genomisekvensointitiedot ovat osoittaneet 'kaksoismutantista' 61 %:ssa näytteistä Maharashtran alueella. Mutta ajaako tämä uusi muunnelma Intian jatkuvaa nousua, voidaan sanoa vasta, kun lisätietoja on saatavilla.

Terveydenhuollon työntekijät valmistelevat sänkyjä Shehnai Banquet Hallissa New Delhissä, joka on muutettu väliaikaiseksi osastoksi Covid-9-potilaille. (Express Photo: Amit Mehra)

Viime viikolla Maharashtran piirilaboratorioiden kanssa pidetyssä kokouksessa National Institute of Virology (NIV) jakoi rajoitettuja tietoja, jotka osoittivat 361 tämän vuoden tammikuun ja maaliskuun välisenä aikana kerätyn genomisekvensoidun näytteen hajoamisen.

Otsikon havainto analyysi : kaksoismutaatio havaittiin 220 - lähes 61 prosentissa - näytteistä. Tämä kaksoisvariantti luokiteltiin viime viikolla B.1.617-variantiksi.

Uutiskirje| Napsauta saadaksesi päivän parhaat selitykset postilaatikkoosi

Mikä on B.1.617?

SARS-CoV-2:n B.1.617-variantissa on kaksi mutaatiota, E484Q ja L452R. Molemmat löytyvät erikseen monista muista koronaviruksen muunnelmista, mutta ne on raportoitu yhdessä ensimmäistä kertaa Intiassa.

Nämä kaksi mutaatiota löytyvät viruksen piikkiproteiinista. Piikkiproteiini auttaa virusta sitoutumaan ihmissolun reseptoreihin ja pääsemään isäntäsoluun.

E484Q-mutaatio on samanlainen kuin E484K, mutaatio, joka löytyy Yhdistyneestä kuningaskunnasta (linja B.1.1.7) ja Etelä-Afrikasta (B.1.351) koronaviruksen muunnelmista.

L452R-mutaatio on löydetty nopeasti leviävistä varianteista Kaliforniassa (B.1.427 ja B.1.429). Se voi lisätä piikkiproteiinien sitoutumisvoimaa ACE2-reseptoreihin ihmissoluissa, mikä tekee siitä tarttuvamman. L452R voi myös mahdollisesti tehostaa viruksen replikaatiota.

Yhdessä E484Q ja L452R ovat tarttuvampia ja voivat välttää vasta-aineita.

Mistä B.1.617 on löydetty?

Tietoja on rajoitetusti. Siitä kerrottiin ensimmäisenä Maharashtrasta. Tammikuussa sekvensoitiin 19 näytettä eri piireistä ja B.1.617 löydettiin neljästä. Helmikuussa 234 näytettä sekvensoitiin 18 piiristä, ja 151 näytettä - vähintään 16 piiristä - oli tämä variantti. Ja maaliskuussa peräti 65 näytteestä 94 näytteestä oli sitä.

Toistaiseksi Amravatin, Nagpurin, Akolan, Wardhan, Punen, Thanen, Aurangabadin ja Chandrapurin piirit ovat esittäneet vahvoja todisteita B.1.617:n esiintymisestä. Muilla alueilla sekvensoitiin vähemmän näytteitä, ja variantti löydettiin joistakin. Sekvensointi odottaa lisää näytteitä.

LIITY NYT :Express Explained Telegram -kanava

Onko tämä variantti virulentti?

Toistaiseksi ei ole todisteita. Useimmat potilaat voivat tehdä kotieristyksen, vaikka kliininen kokemus on yhdistettävä genomin sekvensointitietoihin tieteellisen näytön saamiseksi. Lääkäreiden kliiniset anekdootit viittaavat siihen, että variantti leviää nopeammin, on tarttuvampi, voi tartuttaa kokonaisia ​​perheitä, mutta se on vähemmän virulentti eikä aiheuta dramaattisesti enemmän sairaalahoitoja.

Useimmat potilaat ovat oireettomia, mikä on hyvä merkki. Mutta absoluuttisina lukuina niin monet tapaukset ovat rasittaneet terveydenhuoltoinfrastruktuuria, sanoi tohtori Shashank Joshi, Maharashtra Covid Task Force -työryhmän asiantuntija.

Kuinka paljon se on levinnyt?

Tohtori Sujeet Singh, National Center for Disease Control Center (NCDC) johtaja on huomauttanut, että hyvin vähän näytteitä Maharashtrasta on toistaiseksi sekvensoitu, ja on liian aikaista tehdä lopullisia johtopäätöksiä kaksoismutantin levinneisyydestä. Keskushallinto oli kuitenkin raportoinut maaliskuussa, että 15-20 prosentissa näytteistä Maharashtrassa oli tämä variantti; Viimeisimpien sekvensointitietojen perusteella tiedämme, että tämä luku on nyt yli 60 prosenttia.

Maharashtran lääkärit ja piiriviranomaiset raportoivat, että toisin kuin ensimmäisessä aallossa, kokonaiset perheet saavat tartunnan toisessa aallossa. Tämä voi viitata joko siihen, että fyysinen etäisyys ja eristystoimet eivät ole riittäviä kotitaloudessa tai että virus on levinnyt paremmin.

Voisiko B.1.617 ohjata jatkuvaa Covid-19-tapausten nousua?

Tohtori Gangandeep Kang, mikrobiologian professori Christian Medical Collegesta, Velloressa, sanoi, että 60,9 prosentissa näytteistä, jotka sisälsivät tätä varianttia, ilmeni todennäköisesti yhteys mutaation ja nousun välillä – tarkan vastauksen saamiseksi kuitenkin vähintään 1 prosentti Covid-19-näytteistä. on järjestettävä joka viikko. Intiassa testataan tällä hetkellä yli 1 000 tapausta päivittäin, ja tämä tarkoittaisi noin 1 000 genomisekvenssiä joka päivä.

Meidän on myös tarkasteltava, kuinka monta ihmistä henkilö pystyy tartuttamaan, ja RT-PCR-syklin kynnystä. Meidän on tehtävä live-seurantaa. Tammikuun tiedoilla on vähän arvoa huhtikuussa, tohtori Kang sanoi.

Tohtori Gautam Menon, professori Ashoka-yliopistosta Sonepatista ja Matemaattisten tieteiden instituutista Chennaista, sanoi: Se, mitä meillä on, on vihjailevaa, mutta tarvitsemme lisää genomin sekvensointitietoja ymmärtääksemme, mikä variantti aiheuttaa uusien infektioiden määrää eri osavaltioissa… Jotta voimme olettaa, että tapausten lisääntyminen johtuu tästä kaksoismutanttivariantista, meillä pitäisi olla enemmän aikapisteitä. Esimerkiksi, jos voisimme sanoa, että havaitsimme 30 prosenttia tästä variantista näytteistä 30. maaliskuuta ja sitten 40 prosenttia näytteistä 14. huhtikuuta, se osoittaisi, että uusi variantti hallitsee taudin leviämistä.

Myös tohtori Menon korosti tarvetta lisätä tietojen läpinäkyvyyttä. On mahdollista, vaikkakin yhä epätodennäköisempää, että tapaukset voisivat liittyä myös edelliseen kantaan, hän sanoi. Ellemme tiedä, missä määrin lisääntyminen johtuu uudesta variantista, emme pysty lopullisesti määrittämään, vaikuttivatko nousut Covid-sopivassa käyttäytymisessä vanhemmalla kannalla vai onko syynä uuden muunnelman lisääntynyt tarttuvuus.

Professori Vinod Scaria, johtava tutkija, CSIR -IGIB, oli samaa mieltä siitä, että emme voi lopullisesti sanoa, että nämä muunnelmat ohjaavat toisen aallon nousua. Todisteet viittaavat kuitenkin siihen, että ainakin joissakin osavaltioissa B.1.1617-sukulinja on hallitseva, ja se voi myötävaikuttaa tapausten lisääntymiseen, hän sanoi. Tämän sukulinjan määrittelee 15 geneettistä muunnelmaa, mukaan lukien kuusi piikkiproteiinivarianttia. Kaksi näistä (E484Q ja L452R) liittyvät immuunipakkoon sekä lisääntyneeseen tarttuvuuteen, professori Scaria sanoi.

Voiko versio välttää rokotteet?

Jälleen tiedot ovat rajalliset. Jotkut ihmiset ovatkin saaneet tartunnan ensimmäisen annoksen jälkeen, mutta siitä ei ole tietoa, lähetettiinkö heidän näytteensä genomin sekvensointiin.

Tiedämme, että eteläafrikkalainen variantti pystyy paremmin pakenemaan immuunivastetta. Tiedämme, että Yhdistyneen kuningaskunnan variantti on tarttuvin. Mutta emme tiedä toistaiseksi mitään B.1.617:stä, koska emme kokoa tietoja tehdäksemme johtopäätöksiä, tohtori Kang sanoi.

Tohtori Menon korosti, että vaikka rokotteiden ei odoteta estävän tartuntaa, ne varmasti estävät vakavia sairauksia ja kuoleman. Odotamme tämän pysyvän totta myös uuden version kanssa. Ainoa keskipitkän ja pitkän aikavälin ratkaisu covid-19-viruksen hallintaan on ihmisten rokottaminen.

Jaa Ystäviesi Kanssa: