Selitetty: Kuinka TrueNat-testi toimii

Covid-19:ää aiheuttavalla SARS-CoV-2-viruksella ei ole DNA:ta, vaan RNA-molekyyli. Käänteistranskriptioprosessi (RT-PCR:ssä RT) muuntaa RNA:n DNA-molekyyliksi ennen kuin geeni voidaan siepata testissä.

Testinäyte ladataan TrueNat-sirulle. (Lähde: Molbio Diagnostics)

Muutama viikko sitten Intian lääketieteellisen tutkimuksen neuvosto (ICMR) hyväksyi käytön TrueNat-koneet Goassa toimivan yrityksen valmistama Covid-19-taudin varmistustestien suorittamiseen. Ennen sitä näitä alun perin muutama vuosi sitten potilaiden tuberkuloosin havaitsemiseen kehitettyjä koneita käytettiin nykyisessä koronaviruspandemiassa vain potilaiden seulonnassa.

ICMR-hyväksynnän jälkeen näitä koneita etsivät nyt useat osavaltiot, erityisesti ne, joilla ei ole vahvaa laboratorioverkostoa, jota tarvitaan perinteisten RT-PCR-testien suorittamiseen. Uttar Pradeshilla on käytössä 117 konetta kaikilla 75 alueella, kun taas Bihar on tilannut 50 konetta. Jharkhand, Chhattisgarh, Odisha, Telangana ja Andhra Pradesh ovat kaikki etsineet näitä koneita, ja monet niistä on jo otettu käyttöön.

Miten TrueNat toimii?

Tämän ymmärtäminen auttaa ymmärtämään, kuinka perinteiset PCR-testit toimivat. PCR on menetelmä tietyn geenin sieppaamiseksi vanupuikkonäytteen DNA:sta ja sen monistamiseksi useiden kemiallisten prosessien avulla, jotta se voidaan havaita käyttämällä fluoresoivia väriaineita. Useimmat nykyaikaiset PCR-testit, joita käytetään myös muunlaisten virusten havaitsemiseen, toimivat reaaliajassa. Tulos näkyy myös ketjureaktion aikana.

Covid-19:ää aiheuttavalla SARS-CoV-2-viruksella ei ole DNA:ta, vaan RNA-molekyyli. Käänteistranskriptioprosessi (RT-PCR:ssä RT) muuntaa RNA:n DNA-molekyyliksi ennen kuin geeni voidaan siepata testissä.

TrueNat on sirupohjainen, paristokäyttöinen RT-PCR-sarja. Aluksi se pystyi tunnistamaan vain E-geenin SARS-CoV-2-viruksesta. Tämä on geeni, joka auttaa virusta rakentamaan pallomaisen vaipan ympärilleen. Tässä vaiheessa seulontatestinä käytettiin TrueNat-koneita. E-geenillä havaitut näytteet voitiin lähettää vahvistaviin RT-PCR-testeihin laboratorioihin. Mutta uudet koneet on nyt varustettu havaitsemaan viruksen RNA:sta löytyvä RdRp-entsyymi, ja siksi ICMR on päättänyt, että näitä testejä voidaan pitää vahvistuksena uuden koronaviruksen olemassaolosta.

Suuri ero on se, että kone on kannettava, ja testit sillä maksavat paljon vähemmän kuin perinteiset RT-PCR-testit. Tämä tekee siitä erittäin hyödyllisen käyttöön sisäalueilla ja kaukaisissa paikoissa, joista vanupuikkojen kerääminen ja lähettäminen testattavaksi suuriin kaupunkeihin on vaikea tehtävä. Itse asiassa nämä koneet on jo otettu käyttöön Andhra Pradeshin pohjoisen rannikkovyöhykkeen kylissä ja Gadchirolin alueen metsäisillä alueilla.

Miten testi suoritetaan?

Kun vanupuikko on kerätty näille paikoille perustetuista kioskeista tai suojavyöhykkeistä tai terveysleireistä, se kastetaan viruksen leviämisväliaineeseen, jossa se neutraloituu. Perusterveydenhuollossa tai läheisessä laboratoriossa se siirretään toiseen nesteeseen, viruksen hajoamiseen, jossa solut hajoavat ja epäpuhtaudet poistetaan. Osa tästä nesteestä siirretään sitten litteältä nauhakasetilta näyttävään patruunaan ja asetetaan koneen sisään aivan kuten kasettisoitin. Toistopainike aktivoi prosessin. Vain noin 20 minuutissa prosessi erottaa RNA:n, genomiohjeiden allekirjoitusjoukon, joka käskee solun moninkertaistamaan viruksen, kun se saapuu ihmissoluun. Tämä RNA-uute siirretään sitten toiseen koneeseen, jossa neste vapautetaan pieneen kuoppaan, joka on kiinnitetty elektroniseen siruun, joka ei ole suurempi kuin ihmisen peukalo.

Pienoiskuoppa on paikka, jossa reagenssi aktivoi RNA:n, mutta siru, johon syötetään kaikki viruskuormituslaskelmat, auttaa havaitsemaan, kantaako henkilö virusta vai ei. Toisin kuin perinteisissä RT-PCR-testeissä, reagenssit eivät vaadi tässä prosessissa äärimmäisiä lämpötiloja, ja myös testaukseen tarvittava vanupuikkomäärä on paljon pienempi.

Ottaen huomioon, että koneet on kehitetty tuberkuloosin testausta varten, vaativatko ne mukauttamista Covid-19-testaukseen?

Goassa toimivan Molbio Diagnostics Private Limitedin suunnittelema kone on alun perin kehitetty tuberkuloosin diagnosointiin, jota sairastaa vähintään miljoona lasta vuosittain. Ainakin vuosikymmenen tutkimuksen tuloksena nämä koneet olivat vasta äskettäin hyväksyneet Maailman terveysjärjestön (WHO), joka totesi, että nämä koneet osoittivat samanlaista tarkkuutta kuin muut WHO:n tähän tarkoitukseen hyväksymät kaupalliset tuotteet. Nämä koneet olivat valmiita käyttöönotettavaksi tämän vuoden huhtikuusta alkaen.

Silloin Covid tapahtui, sanoi Shiva Sriram, Molbio Diagnosticsin kansallinen myyntipäällikkö, joka istui Goan valmistusdivisioonassa. Tuberkuloosi vaatii varhaista havaitsemista, ja siksi on tärkeää saada tarkka diagnoosi. Toisin kuin sivelymikroskoopilla, jonka tarkkuus on 50:50, halusimme saavuttaa paremman tarkkuuden ja jatkoimme tutkimustamme. Se on ollut 18 vuotta tutkimusta…”, hän sanoi.

Koneen sydän on suunniteltu havaitsemaan erilaisia ​​infektioita. Se on siru, joka on erityinen jokaiselle infektiolle. Yrityksellä kesti 15 päivää suunnitella siru, jossa oli kaikki viruskuormadiagnoosi koronaviruksen havaitsemiseksi.

Sriramin mukaan yhtiöllä oli kiire tehdä toimitusjärjestelyjä terveysministeriön sille toimittaman tuberkuloosin diagnostiikkaa varten. Viisisataa konetta jaettiin kaikkien osavaltioiden ja liittovaltioiden kesken. Sen jälkeen osavaltiot olivat alkaneet tehdä tilauksia itse. Tällä hetkellä noin 1 000 konetta on jo varattu, ja odotamme vielä 3 000–4 000 tilattavan seuraavan kahden kuukauden aikana, hän sanoi.

Goa osti ensimmäisenä uuden muunnetun koneen Covid-19-seulontaan. Mutta Andhra Pradesh oli osavaltio, joka käytti sitä laajimmin ja suoritti yli 2,5 lakh seulontatestejä.

Kysyntä kasvoi, kun tapaukset alkoivat lisääntyä Biharin, Uttar Pradeshin ja Odishan kaltaisissa osavaltioissa, kun siirtolaiset alkoivat palata toukokuun toisella viikolla. Kone on jo mahdollistanut ovelta ovelle -tutkimukset monissa osissa näitä osavaltioita.

Miten TrueNat vertaa perinteisiin testeihin?

Perinteinen RT-PCR edellyttää RNA:n uuttamista ja analysointia kahdessa eri huoneessa, joissa on kylmävarasto ja koulutetut asiantuntijat, jotka käsittelevät laboratoriossa suunniteltuja laitteita. Toisaalta TrueNat on suunniteltu ensisijaisesti toimimaan syrjäisissä paikoissa, ja sitä pidetään 'viimeisen kilometrin diagnostiikkana'.

Kone on kannettava ja kuljetettavissa salkussa, akkukäyttöinen yhdellä latauksella, kestää kymmenen tuntia. Kahdeksan tunnin työvuoro antaa 45 testiä ja useimmissa osavaltioissa on tällä hetkellä kolme vuoroa päivässä, Sriram sanoi. Suurin osa osavaltioista on myös tilannut neljän peliautomaatin, jonka avulla voidaan suorittaa neljä testiä samanaikaisesti, hän sanoi.

Jokainen neljästä peliautomaatista maksaa yli 13 000 rupiaa, mutta testisarjan hinta on vain noin 1 300 rupiaa.

Jaa Ystäviesi Kanssa: