Selitetty: Koronaviruksen runsaan, erittäin tarttuvan mutaation ymmärtäminen
Covid-19-mutaatiot: Tähän mennessä maailmanlaajuisesti on dokumentoitu 12 000 mutaatiota yli 3,2 miljoonassa tapauksessa. Yksi mutaatio on havaittu laajimmalle. Se havaittiin ensimmäisen kerran Kiinassa ja Saksassa.
RNA-virukset, kuten SARS-CoV-2, mutatoituvat hitaasti, koska ne tarvitsevat isännän (ihmissolun) replikoituakseen. (Tiedostokuva/edustus) Koronavirus SARS-CoV-2 mutatoituu jatkuvasti, mutta erityisesti yksi mutaatio on kiinnittänyt tutkijoiden huomion runsaudesta. Tämä D614G-niminen mutaatio on havaittu tarttuvammaksi kuin useimmat muut.
Mikä on D614G-mutaatio?
Kaikki virukset muuntuvat mukautuakseen ihmisten asettamiin esteisiin. RNA-virukset, kuten SARS-CoV-2, mutatoituvat hitaasti, koska ne tarvitsevat isännän (ihmissolun) replikoituakseen.
Tähän mennessä maailmanlaajuisesti on dokumentoitu 12 000 mutaatiota yli 3,2 miljoonassa tapauksessa. Yksi mutaatio on havaittu laajimmalle. Se havaittiin ensin Kiinassa ja Saksassa, mutta sai huomiota, kun se ilmaantui useissa tapauksissa ympäri Eurooppaa ja lopulta Yhdysvalloissa, Kanadassa, Australiassa ja Intiassa. Tässä mutaatiossa glysiini (G) korvaa asparagiinihapon (D) aminohapon 614. kohdassa. Tästä syystä mutaatiosta alettiin kutsua 'D614G'.
IND614G,G (glysiini) korvaa D:n (asparagiinihapon) 614. asemassa. (Korberet al/Cell) Mikä tekee tästä mutaatiosta erilaisen kuin muut?
Tämän ymmärtämiseksi meidän on ymmärrettävä, kuinka SARS-CoV-2 pääsee ihmissoluun. Aminohapot, joissa mutaatio tapahtuu, sijaitsevat viruksen piikkiproteiinissa. Piikkiproteiinit sitoutuvat ihmissolun ACE2-reseptoriin ja pääsevät sisään.
Tri Rajesh Pandey, CSIR-Institute of Genomics and Integrative Biology -tutkija, selitti, että piikkiproteiinissa olevat peptidit lukittuvat ACE2-reseptoriin. D614G-mutaatiossa kaksi kolmesta peptidistä avautuu, mikä lisää mahdollisuuksia päästä ihmisen soluun. Kuvittele käsi, jossa on kolme sormea. Jos vain yksi sormi avautuu, sillä on rajoitettu pääsy esineiden poimimiseen, mutta jos kaksi sormea avautuu, ne voivat poimia enemmän esineitä. Nämä kaksi peptidiä lisäävät viruksen mahdollisuuksia päästä ihmisen soluun.
Koska sen luonne mahdollistaa paremmat mahdollisuudet päästä isäntäsoluun kuin muut mutatoidut kannat, D614G:llä on suurempi siirtonopeus. GISAID, maailmanlaajuinen virustietokanta, joka on dokumentoinut kaikki kiertävät SARS-CoV2-kannat, osoittaa, että mutatoitunut kanta nousi maaliskuusta eteenpäin Euroopassa.
Express selitettyon nyt päälläTelegram. Klikkaus tästä voit liittyä kanavallemme (@ieexplained) ja pysy ajan tasalla uusimmista
Mitä seurauksia tällä on?
Virus mutatoituu joka kerta, kun se replikoituu ihmissolussa mukautuakseen ja selviytyäkseen. Tämä mutaatio auttaa virusta tekemään juuri sen. GISAID-tiedot osoittavat maaliskuun alkuun asti, että tämä mutaatio oli harvinainen, mutta nousi hallitsevaksi Euroopassa.
Cell-julkaisussa havaittiin: Ennen 1. maaliskuuta 2020 sitä (D614G) löydettiin 10 prosentista 997 globaalista sekvenssistä; 1. maaliskuuta ja 31. maaliskuuta 2020 välisenä aikana se edusti 67 % 14 951 sekvenssistä; ja 1. huhtikuuta ja 18. toukokuuta 2020 välisenä aikana se edusti 78 % 12 194 sekvenssistä.
Medrxivin esipainetussa paperissa havaittiin, että tällä mutaatiolla tartunnan saaneilla potilailla oli huomattavasti suurempi viruskuorma nenänielassa alkuperäisen diagnoosin yhteydessä. Tutkimuksessa sekvensoitiin 5 085 SARS-CoV-2-kannan genomit Houstonissa.
Kanta on kasvanut, siirtynyt nopeasti, koska se pääsee helposti soluun. Tämä antoi sille hypeä, sanoi mikrobiologi tohtori Jayanthi Shastri Kasturba Laboratorysta Mumbaista. Shastri sanoi, että alustavat tutkimukset osoittivat, että D614G voi aiheuttaa enemmän tartuntaa ja vaikeita oireita. Aluksi havaitsimme vakavaa tarttuvuutta, mutta ajan kuluessa näytteistämme on nähty, että tarttuvuutta ei voida suoraan yhdistää mutaatioon, vaan myös muilla samanaikaisilla tekijöillä on roolinsa, hän sanoi. Toistaiseksi ei ole olemassa tarpeeksi pitkittäisiä tutkimuksia suoran yhteyden luomiseksi D614G:n ja lisääntyneen kuolleisuuden välille. Tätä varten meidän on suoritettava genomin sekvensointi useille vaikeille potilaille tarkistaaksemme, onko tämä mutaatio läsnä, Shastri sanoi.
Myös selityksessä | Uusi tutkimus: Kalsiumia sisältävät nenäsuolat vähentävät uloshengitettyä aerosolia
Onko se yleistä Intiassa?
The Lancet julkaisi ennakkotulosteen Covid-19-uudelleentartunnasta neljässä terveydenhuollon työntekijässä Mumbaissa. Kasturba Hospitalin, Kansainvälisen geenitekniikan ja bioteknologian keskuksen ja CSIR-Institut of Genomics and Integrative Biology -tutkimuksessa löydettiin D614G-mutaatio kolmesta niistä. Yhdellä lääkärillä, joka sai uudelleen tartunnan toisen kerran, D614G-mutaatio oli läsnä. Hän sai vakavia oireita ja tarvitsi plasmahoitoa. Emme kuitenkaan voi olla varmoja, että yhdistämme D614G:n suoraan infektion vakavuuteen, Shastri sanoi.
Toisella lääkärillä D614G oli läsnä ensimmäisessä infektiossa, mutta se ei johtanut vakaviin oireisiin.
Ei täysin tiedetä, voiko mutaatio aiheuttaa kuoleman vai voidaanko siihen puuttua rokotteilla. Jotkut tutkimukset ovat osoittaneet, että se ei johda vakavaan infektioon keuhkoissa.
Onko se rokotuskohde?
Sen runsaus tarjoaa tutkijoille mahdollisuuden tutkia ja kohdistaa sen mekanismia. Pfizer kehittää rokoteehdokasta, jossa vasta-aineet estävät viruksen reseptoria sitovan domeenin. Rokotteen saksalainen koe on osoittanut lupaavia tuloksia D614G-kantaa vastaan.
Biorxivissa 2. syyskuuta julkaistu esipainettu paperi oli optimistinen, että mutaatio ei ehkä heikennä rokotteen tehokkuutta sitä vastaan.
Jaa Ystäviesi Kanssa:
